Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ebf1Q07802 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ebf1Q07802 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ebf1Q07802 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms