Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdx4Q07424 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms