Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccl7Q03366 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl7Q03366 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms