Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vgll3P85442 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vgll3P85442 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vgll3P85442 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms