Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp8a1P70704 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8a1P70704 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp8a1P70704 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms