Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp9xP70398 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp9xP70398 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms