Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufd1P70362 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms