Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl23P62830 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl23P62830 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms