Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snrpd3P62320 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms