Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp46P62069 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp46P62069 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp46P62069 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp46P62069 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp46P62069 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp46P62069 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp46P62069 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp46P62069 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp46P62069 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp46P62069 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp46P62069 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp46P62069 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp46P62069 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp46P62069 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp46P62069 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms