Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chp1P61022 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chp1P61022 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chp1P61022 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chp1P61022 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chp1P61022 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chp1P61022 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chp1P61022 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chp1P61022 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chp1P61022 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chp1P61022 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chp1P61022 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chp1P61022 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chp1P61022 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chp1P61022 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chp1P61022 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chp1P61022 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chp1P61022 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chp1P61022 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chp1P61022 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chp1P61022 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chp1P61022 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chp1P61022 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chp1P61022 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chp1P61022 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms