Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fdft1P53798 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fdft1P53798 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fdft1P53798 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fdft1P53798 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fdft1P53798 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fdft1P53798 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fdft1P53798 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms