Protein–RNA interactions for Protein: P50592

Tnfsf10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf10P50592 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf10P50592 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf10P50592 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf10P50592 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf10P50592 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf10P50592 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnfsf10P50592 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf10P50592 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf10P50592 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf10P50592 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf10P50592 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf10P50592 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfsf10P50592 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfsf10P50592 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfsf10P50592 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms