Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdkn1cP49919 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkn1cP49919 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms