Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox8bP48772 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox8bP48772 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cox8bP48772 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms