Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HttP42859 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HttP42859 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HttP42859 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HttP42859 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HttP42859 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HttP42859 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HttP42859 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HttP42859 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HttP42859 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HttP42859 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HttP42859 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HttP42859 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HttP42859 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HttP42859 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HttP42859 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HttP42859 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HttP42859 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HttP42859 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HttP42859 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HttP42859 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HttP42859 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HttP42859 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HttP42859 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HttP42859 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HttP42859 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HttP42859 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HttP42859 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HttP42859 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HttP42859 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HttP42859 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HttP42859 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HttP42859 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HttP42859 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HttP42859 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HttP42859 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HttP42859 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HttP42859 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HttP42859 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HttP42859 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HttP42859 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HttP42859 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HttP42859 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HttP42859 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HttP42859 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HttP42859 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HttP42859 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HttP42859 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HttP42859 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HttP42859 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HttP42859 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HttP42859 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HttP42859 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HttP42859 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HttP42859 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HttP42859 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HttP42859 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HttP42859 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HttP42859 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HttP42859 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HttP42859 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HttP42859 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HttP42859 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HttP42859 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HttP42859 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HttP42859 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HttP42859 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HttP42859 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HttP42859 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HttP42859 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HttP42859 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HttP42859 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HttP42859 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HttP42859 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HttP42859 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HttP42859 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HttP42859 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HttP42859 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HttP42859 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HttP42859 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HttP42859 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HttP42859 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HttP42859 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HttP42859 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HttP42859 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HttP42859 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HttP42859 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HttP42859 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HttP42859 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HttP42859 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HttP42859 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HttP42859 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HttP42859 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HttP42859 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HttP42859 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HttP42859 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HttP42859 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HttP42859 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HttP42859 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HttP42859 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms