Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpargP37238 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpargP37238 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpargP37238 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpargP37238 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpargP37238 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PpargP37238 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PpargP37238 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PpargP37238 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PpargP37238 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PpargP37238 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PpargP37238 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PpargP37238 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpargP37238 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpargP37238 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpargP37238 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpargP37238 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpargP37238 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpargP37238 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpargP37238 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpargP37238 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpargP37238 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpargP37238 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpargP37238 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpargP37238 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PpargP37238 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpargP37238 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpargP37238 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpargP37238 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpargP37238 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpargP37238 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpargP37238 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpargP37238 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpargP37238 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PpargP37238 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PpargP37238 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PpargP37238 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PpargP37238 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PpargP37238 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PpargP37238 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PpargP37238 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PpargP37238 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PpargP37238 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PpargP37238 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PpargP37238 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PpargP37238 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpargP37238 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpargP37238 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpargP37238 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpargP37238 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpargP37238 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpargP37238 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpargP37238 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpargP37238 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PpargP37238 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PpargP37238 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpargP37238 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpargP37238 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpargP37238 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpargP37238 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpargP37238 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpargP37238 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpargP37238 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpargP37238 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PpargP37238 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PpargP37238 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PpargP37238 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PpargP37238 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PpargP37238 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PpargP37238 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PpargP37238 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PpargP37238 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PpargP37238 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PpargP37238 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PpargP37238 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PpargP37238 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PpargP37238 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PpargP37238 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PpargP37238 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PpargP37238 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PpargP37238 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PpargP37238 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PpargP37238 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PpargP37238 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PpargP37238 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PpargP37238 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PpargP37238 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PpargP37238 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PpargP37238 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PpargP37238 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PpargP37238 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PpargP37238 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PpargP37238 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PpargP37238 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PpargP37238 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PpargP37238 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PpargP37238 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PpargP37238 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PpargP37238 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PpargP37238 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms