Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HexaP29416 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HexaP29416 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HexaP29416 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HexaP29416 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HexaP29416 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HexaP29416 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HexaP29416 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HexaP29416 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HexaP29416 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HexaP29416 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HexaP29416 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HexaP29416 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HexaP29416 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HexaP29416 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HexaP29416 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HexaP29416 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HexaP29416 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HexaP29416 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HexaP29416 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HexaP29416 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HexaP29416 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HexaP29416 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HexaP29416 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HexaP29416 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HexaP29416 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HexaP29416 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HexaP29416 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HexaP29416 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HexaP29416 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HexaP29416 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HexaP29416 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HexaP29416 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HexaP29416 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HexaP29416 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HexaP29416 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HexaP29416 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HexaP29416 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HexaP29416 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HexaP29416 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HexaP29416 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HexaP29416 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HexaP29416 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HexaP29416 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HexaP29416 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HexaP29416 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HexaP29416 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HexaP29416 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HexaP29416 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HexaP29416 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HexaP29416 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HexaP29416 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HexaP29416 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HexaP29416 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HexaP29416 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HexaP29416 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HexaP29416 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HexaP29416 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HexaP29416 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HexaP29416 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HexaP29416 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HexaP29416 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HexaP29416 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HexaP29416 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HexaP29416 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HexaP29416 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HexaP29416 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HexaP29416 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HexaP29416 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HexaP29416 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HexaP29416 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HexaP29416 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HexaP29416 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HexaP29416 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HexaP29416 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HexaP29416 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HexaP29416 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HexaP29416 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HexaP29416 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HexaP29416 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HexaP29416 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HexaP29416 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HexaP29416 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HexaP29416 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HexaP29416 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HexaP29416 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HexaP29416 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HexaP29416 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HexaP29416 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HexaP29416 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HexaP29416 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HexaP29416 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HexaP29416 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HexaP29416 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HexaP29416 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HexaP29416 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HexaP29416 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HexaP29416 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HexaP29416 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HexaP29416 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms