Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Etv4P28322 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Etv4P28322 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Etv4P28322 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Etv4P28322 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Etv4P28322 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Etv4P28322 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Etv4P28322 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Etv4P28322 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Etv4P28322 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Etv4P28322 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Etv4P28322 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Etv4P28322 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Etv4P28322 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Etv4P28322 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Etv4P28322 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Etv4P28322 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Etv4P28322 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Etv4P28322 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Etv4P28322 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Etv4P28322 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Etv4P28322 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Etv4P28322 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Etv4P28322 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Etv4P28322 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms