Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Aldh1a1P24549 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aldh1a1P24549 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh1a1P24549 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh1a1P24549 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms