Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp53P15975 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp53P15975 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp53P15975 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp53P15975 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp53P15975 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp53P15975 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp53P15975 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp53P15975 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp53P15975 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp53P15975 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp53P15975 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms