Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrphP15331 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrphP15331 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrphP15331 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrphP15331 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrphP15331 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrphP15331 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrphP15331 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrphP15331 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrphP15331 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrphP15331 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrphP15331 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrphP15331 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrphP15331 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PrphP15331 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrphP15331 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrphP15331 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrphP15331 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrphP15331 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrphP15331 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrphP15331 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrphP15331 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrphP15331 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrphP15331 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrphP15331 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PrphP15331 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrphP15331 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PrphP15331 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrphP15331 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrphP15331 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrphP15331 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrphP15331 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PrphP15331 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrphP15331 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrphP15331 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrphP15331 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrphP15331 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrphP15331 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrphP15331 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrphP15331 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrphP15331 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrphP15331 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrphP15331 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrphP15331 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrphP15331 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrphP15331 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrphP15331 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrphP15331 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PrphP15331 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrphP15331 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrphP15331 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrphP15331 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrphP15331 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrphP15331 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrphP15331 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrphP15331 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrphP15331 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrphP15331 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrphP15331 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrphP15331 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrphP15331 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrphP15331 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrphP15331 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrphP15331 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrphP15331 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrphP15331 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PrphP15331 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrphP15331 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrphP15331 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrphP15331 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrphP15331 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PrphP15331 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrphP15331 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrphP15331 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrphP15331 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrphP15331 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrphP15331 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrphP15331 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PrphP15331 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrphP15331 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrphP15331 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrphP15331 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PrphP15331 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrphP15331 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrphP15331 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrphP15331 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrphP15331 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrphP15331 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrphP15331 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrphP15331 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrphP15331 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrphP15331 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrphP15331 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrphP15331 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PrphP15331 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrphP15331 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrphP15331 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrphP15331 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrphP15331 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrphP15331 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms