Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa1P11477 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Defa1P11477 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Defa1P11477 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Defa1P11477 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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