Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolP11369 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolP11369 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolP11369 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolP11369 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolP11369 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolP11369 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolP11369 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolP11369 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolP11369 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolP11369 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolP11369 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolP11369 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolP11369 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolP11369 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolP11369 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolP11369 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolP11369 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolP11369 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolP11369 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolP11369 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolP11369 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolP11369 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolP11369 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolP11369 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolP11369 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolP11369 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolP11369 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolP11369 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolP11369 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolP11369 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolP11369 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolP11369 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PolP11369 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PolP11369 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PolP11369 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PolP11369 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PolP11369 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PolP11369 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PolP11369 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PolP11369 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PolP11369 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PolP11369 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PolP11369 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PolP11369 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PolP11369 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PolP11369 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PolP11369 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PolP11369 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PolP11369 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PolP11369 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PolP11369 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PolP11369 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PolP11369 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PolP11369 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PolP11369 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PolP11369 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PolP11369 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PolP11369 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PolP11369 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolP11369 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolP11369 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolP11369 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolP11369 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolP11369 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PolP11369 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolP11369 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolP11369 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolP11369 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolP11369 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolP11369 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolP11369 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PolP11369 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PolP11369 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PolP11369 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PolP11369 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PolP11369 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolP11369 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolP11369 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolP11369 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolP11369 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolP11369 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolP11369 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolP11369 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PolP11369 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolP11369 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolP11369 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolP11369 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PolP11369 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PolP11369 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PolP11369 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PolP11369 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PolP11369 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PolP11369 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PolP11369 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PolP11369 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PolP11369 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PolP11369 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PolP11369 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PolP11369 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms