Protein–RNA interactions for Protein: P0C7N9

Psmg4, Proteasome assembly chaperone 4, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg4P0C7N9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmg4P0C7N9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmg4P0C7N9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms