Protein–RNA interactions for Protein: P0C0A3

Chmp6, Charged multivesicular body protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp6P0C0A3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp6P0C0A3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp6P0C0A3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp6P0C0A3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp6P0C0A3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp6P0C0A3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp6P0C0A3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp6P0C0A3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp6P0C0A3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp6P0C0A3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp6P0C0A3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms