Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr2aP08775 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr2aP08775 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr2aP08775 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Polr2aP08775 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms