Protein–RNA interactions for Protein: O88986

Gcat, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcatO88986 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GcatO88986 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GcatO88986 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GcatO88986 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GcatO88986 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GcatO88986 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GcatO88986 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GcatO88986 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GcatO88986 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GcatO88986 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GcatO88986 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GcatO88986 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GcatO88986 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GcatO88986 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GcatO88986 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GcatO88986 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GcatO88986 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GcatO88986 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GcatO88986 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GcatO88986 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GcatO88986 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GcatO88986 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GcatO88986 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GcatO88986 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GcatO88986 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GcatO88986 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GcatO88986 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GcatO88986 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GcatO88986 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GcatO88986 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GcatO88986 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GcatO88986 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GcatO88986 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GcatO88986 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GcatO88986 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GcatO88986 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GcatO88986 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GcatO88986 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GcatO88986 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GcatO88986 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GcatO88986 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GcatO88986 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GcatO88986 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GcatO88986 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GcatO88986 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GcatO88986 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GcatO88986 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GcatO88986 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GcatO88986 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GcatO88986 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GcatO88986 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GcatO88986 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GcatO88986 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GcatO88986 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GcatO88986 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GcatO88986 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GcatO88986 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GcatO88986 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GcatO88986 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GcatO88986 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GcatO88986 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GcatO88986 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GcatO88986 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GcatO88986 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GcatO88986 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GcatO88986 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GcatO88986 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GcatO88986 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GcatO88986 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GcatO88986 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GcatO88986 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GcatO88986 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GcatO88986 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GcatO88986 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GcatO88986 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GcatO88986 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GcatO88986 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GcatO88986 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GcatO88986 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GcatO88986 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GcatO88986 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GcatO88986 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GcatO88986 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GcatO88986 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GcatO88986 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GcatO88986 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GcatO88986 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GcatO88986 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GcatO88986 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GcatO88986 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GcatO88986 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GcatO88986 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GcatO88986 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GcatO88986 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GcatO88986 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GcatO88986 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GcatO88986 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GcatO88986 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GcatO88986 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GcatO88986 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms