Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkbO55229 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkbO55229 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkbO55229 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkbO55229 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkbO55229 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChkbO55229 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChkbO55229 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChkbO55229 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChkbO55229 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms