Protein–RNA interactions for Protein: O35704

Sptlc1, Serine palmitoyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc1O35704 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sptlc1O35704 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptlc1O35704 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptlc1O35704 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms