Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6aO35464 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sema6aO35464 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6aO35464 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms