Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Polr1aO35134 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Polr1aO35134 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Polr1aO35134 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Polr1aO35134 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Polr1aO35134 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Polr1aO35134 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms