Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp35M0QWN7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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Usp35M0QWN7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Usp35M0QWN7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Usp35M0QWN7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Usp35M0QWN7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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Usp35M0QWN7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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Usp35M0QWN7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp35M0QWN7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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Usp35M0QWN7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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Usp35M0QWN7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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Usp35M0QWN7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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Usp35M0QWN7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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Usp35M0QWN7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Usp35M0QWN7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp35M0QWN7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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