Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm21887J3QQ04 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21887J3QQ04 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm21887J3QQ04 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm21887J3QQ04 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm21887J3QQ04 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm21887J3QQ04 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm21887J3QQ04 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm21887J3QQ04 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm21887J3QQ04 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm21887J3QQ04 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm21887J3QQ04 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm21887J3QQ04 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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