Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms