Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm5798F7BTS7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Gm5798F7BTS7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5798F7BTS7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5798F7BTS7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms