Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
D430041D05RikF6ZGR6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
D430041D05RikF6ZGR6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms