Protein–RNA interactions for Protein: F2YMG0

Prss56, Serine protease 56, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss56F2YMG0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Prss56F2YMG0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prss56F2YMG0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prss56F2YMG0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms