Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp558E9Q1J0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Zfp558E9Q1J0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Zfp558E9Q1J0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp558E9Q1J0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp558E9Q1J0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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