Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30bE9PVL6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30bE9PVL6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30bE9PVL6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms