Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FgaE9PV24 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FgaE9PV24 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FgaE9PV24 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FgaE9PV24 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FgaE9PV24 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
FgaE9PV24 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
FgaE9PV24 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FgaE9PV24 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FgaE9PV24 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FgaE9PV24 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms