Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Cngb1E1AZ71 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cngb1E1AZ71 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cngb1E1AZ71 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cngb1E1AZ71 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Cngb1E1AZ71 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cngb1E1AZ71 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cngb1E1AZ71 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
Cngb1E1AZ71 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms