Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BC035044E0CXF8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BC035044E0CXF8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC035044E0CXF8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms