Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc78D3Z5T1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc78D3Z5T1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc78D3Z5T1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms