Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccnb1ip1D3Z3K2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccnb1ip1D3Z3K2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms