Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc6D3YZP9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc6D3YZP9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc6D3YZP9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms