Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cttnbp2B9EJA2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cttnbp2B9EJA2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cttnbp2B9EJA2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cttnbp2B9EJA2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cttnbp2B9EJA2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Cttnbp2B9EJA2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cttnbp2B9EJA2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Cttnbp2B9EJA2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cttnbp2B9EJA2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cttnbp2B9EJA2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cttnbp2B9EJA2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cttnbp2B9EJA2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cttnbp2B9EJA2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cttnbp2B9EJA2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cttnbp2B9EJA2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Cttnbp2B9EJA2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Cttnbp2B9EJA2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cttnbp2B9EJA2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms