Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm5483B2RV77 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5483B2RV77 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5483B2RV77 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5483B2RV77 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5483B2RV77 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5483B2RV77 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5483B2RV77 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5483B2RV77 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5483B2RV77 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5483B2RV77 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5483B2RV77 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5483B2RV77 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5483B2RV77 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms