Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rd3lB2RV38 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rd3lB2RV38 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rd3lB2RV38 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms