Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brpf1B2RRD7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Brpf1B2RRD7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms