Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Uhrf1bp1B2KF50 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms